化学工程系目前设有化学工程与工艺专业，于2006年9月开始招生。主要培养化学工程与化学工艺领域的专业人才。以国家建设和社会需求为导向，本专业培养具有高度的社会责任感和良好的职业道德，良好的人文社会科学素养和健康的身心素质，具备化学、化学工程与技术及相关学科的基础知识，基本理论和基本技能，具有较强的工程实践能力和创新意识的工程技术人才。本专业持续专业建设与改革，强化教学模式创新，以科研促教学，并开展卓越工程师培养教育。化学工程与工艺专业2011年被列为威廉希尔官网：重点建设专业，2015年，卓越化工工程师培养、化工实验实训中心获得省级立项。
化工系现有专业教师10人。其中教授2人，副教授3人，讲师3人，助教2人。具有博士学位7人，在读博士2人，硕士1人。
专业教师传承严谨治学的优良传统，兢兢业业、刻苦钻研，申报完成多项教学研究项目，通过教学研究和教改实践，在改革化学工程与工艺专业的课程教学内容和课程体系、教学方法和教学手段等方面取得实质性进展和明显成效，极大地推动了本专业的建设与发展。专业教师积极从事科学研究，近五年来，先后承担国家自然科学基金2项，安徽省自然科学基金4项，安徽省教育厅重点科研计划项目2项。指导学生参加全国大学生化工设计竞赛，获得全国一等奖1项，全国二等奖5项，华中赛区三等奖3项。发表高水平科研论文50余篇。
化学工程系拥有良好的实践教学平台。已建成化工原理实验室和化工专业实验室，使用面积400 m2，购置专业教学仪器设备近400万元，能较好满足教学科研的基本需要，2015年，被列为省级示范实验中心。在人才培养上，积极开展卓越工程师培养，结合全国大学生化工设计竞赛等大学生科技创新活动，强化工程实践素质和能力的培养。目前已毕业7届学生，毕业生总数500余人，部分毕业生已经考取东南大学、华东理工大学、合肥工业大学研究生，许多已经成为化工企业、设计院等单位的技术、管理骨干，深受用人单位欢迎。
